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按照鄱阳湖生态经济区建设环境下的应用型人才培养要求，以培养职业能力为主线，以“必须、够用、实用”为原则，按照生物行业标准和生物技术岗位(群)能力，合理设计、优化重组教学内容，构建了理论、实践与素质教学课程体系。根据鄱阳湖生态经济区建设环境下的生物技术应用型人才培养目标的规格与要求，现已对部分专业课程进行改革，如《解剖生理学》改革为《生理学》；增加了生物技术类课程，如《酶工程》、《发酵工程》。《生物化学》课程已开始探索项目式教学方式，《普通生物学》课程已开始探索创新式教学方式等。目前，生物技术及应用专业课程使用多媒体教学的比例达60％。

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